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當(dāng)前位置：模擬計(jì)算 ? 分子動力學(xué) ?

生物信息學(xué)-網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)

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生物信息學(xué)-網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)

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項(xiàng)目介紹

近年來，網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)成為研究中藥學(xué)的重要技術(shù)手段，通過提取鑒定中藥中的有效成分，通過反向找靶尋找活性成分的特定基因，通過PPI網(wǎng)絡(luò)分析和GO富集（或者KEGG富集分析）尋找特定的信號通路，從而為抗腫瘤或者抗血壓等疾病尋找理論依據(jù)，加之分子對接等模擬手段，可以讓文章更為充實(shí)。

樣品要求

1. 科研計(jì)算服務(wù)是一個探索的過程，其中存在不確定性。所有模擬計(jì)算只保證計(jì)算方法正確，至于結(jié)果是否完全符合客戶預(yù)期無法保證。

（例如，DFT所用泛函本身采用了很多近似；另外當(dāng)前的模擬方法也存在很多近似（例如OER過程的吉布斯自由能計(jì)算中會忽略掉催化劑的表面電荷富集效應(yīng)與溶劑效應(yīng)等），這都有可能導(dǎo)致計(jì)算結(jié)果和實(shí)驗(yàn)結(jié)果出現(xiàn)分歧（即某一問題可能是多種因素共同作用的結(jié)果，單純考慮其中某一作用不足以反應(yīng)要研究的問題本質(zhì)，目前也尚未有任何計(jì)算方法可以完全實(shí)現(xiàn)模擬仿真條件與真實(shí)實(shí)驗(yàn)條件的完全一致，因此研究問題的哪個方面需要由客戶最終決定），因此，我們在計(jì)算過程中會盡可能減少可以避免的誤差，但是有些誤差受限于理論本身，不可避免，我們對此引發(fā)的后果不承擔(dān)任何責(zé)任。此外，分子力學(xué)或者分子動力學(xué)等基于分子力場的模擬計(jì)算重現(xiàn)性可能不如第一性原理計(jì)算，因此不保證兩次獨(dú)立的相同體系相同任務(wù)的模擬可以得到完全定量一致的結(jié)果，對此引發(fā)的分歧，我們不承擔(dān)任何責(zé)任）。

2. 請?zhí)峁╆P(guān)于結(jié)構(gòu)或者實(shí)驗(yàn)條件盡可能詳細(xì)的信息。

比如材料中是否有缺陷，空位，是異質(zhì)結(jié)，還是負(fù)載團(tuán)簇模型等。如果不提供影響計(jì)算的關(guān)鍵信息，計(jì)算老師按著自己的理解去計(jì)算，由此導(dǎo)致的結(jié)果和費(fèi)用，請客戶自行承擔(dān)。

3. 原始數(shù)據(jù)保存6個月。

由于超算平臺的數(shù)據(jù)吞吐量較大，因此原始數(shù)據(jù)我們無償為客戶保存6個月，超過6個月的原始數(shù)據(jù)將會被刪除，請客戶知曉。且在6個月內(nèi)只提供原始數(shù)據(jù)，不再接受其他相關(guān)請求。

4. 嚴(yán)格按照計(jì)算方案約定計(jì)算

除本方案約定內(nèi)容之外，客戶如有其他特殊需求，請?zhí)崆案嬷Ｈ绻枰a(bǔ)充計(jì)算可以補(bǔ)充下單。本著學(xué)術(shù)嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膽B(tài)度，我們無法接受“人為調(diào)一下結(jié)果”，“調(diào)下參數(shù)使之更靠近我的預(yù)期”此類要求，所有計(jì)算結(jié)果尊重原始結(jié)果數(shù)據(jù)，敬請客戶不要提出這種要求。如果客戶下單后，又提出此類要求，我們有權(quán)利退單，由此造成的機(jī)時(shí)浪費(fèi)及經(jīng)濟(jì)損失由客戶承擔(dān)。

5. 客戶如對計(jì)算結(jié)果有異議，可以申請復(fù)核。

復(fù)核僅僅檢查“計(jì)算方法是否存在錯誤”，“計(jì)算參數(shù)是否不合理”，“數(shù)據(jù)導(dǎo)入過程是否存在失誤”等問題，如果上述檢查均沒有問題，則認(rèn)定計(jì)算結(jié)果不存在理論上的錯誤，這種情況下，不接受任何無償性質(zhì)的計(jì)算測試以及重新計(jì)算要求，請客戶知曉！

項(xiàng)目案例

常見問題

1、Q1、如果計(jì)算結(jié)果與預(yù)期不符合怎么辦？

1.科研計(jì)算服務(wù)是一個探索的過程，其中存在不確定性。服務(wù)方對理論計(jì)算得到的數(shù)據(jù)負(fù)責(zé)，但不保證理論數(shù)據(jù)能夠與預(yù)期結(jié)果完全一致。如果需要可以對模型進(jìn)行適當(dāng)調(diào)整，調(diào)整過程中若增加計(jì)算或者大規(guī)模的重新計(jì)算，需增加計(jì)算費(fèi)用，價(jià)格另行協(xié)商。

2.模擬計(jì)算存在不確定性，我們對計(jì)算過程的正確性負(fù)責(zé)。計(jì)算開始之后會消耗軟件，機(jī)時(shí)以及人力成本，所以不支持退款，敬請諒解

2、Q2、模擬計(jì)算項(xiàng)目服務(wù)范圍？

1.計(jì)算完成之后提供所需的計(jì)算方法，計(jì)算結(jié)果數(shù)據(jù)和圖文，以及關(guān)于計(jì)算結(jié)果中疑問的解答；

2.文章回復(fù)意見中模擬計(jì)算問題進(jìn)行適當(dāng)?shù)慕獯穑舴蹈搴笮枰黾佑?jì)算，需另行收費(fèi)。

3、Q3、關(guān)于模擬計(jì)算下單流程是怎么樣的呢？

1.如果是確定計(jì)算需求，可以直接在測試狗官網(wǎng)選擇相應(yīng)的項(xiàng)目進(jìn)行下單，提交訂單時(shí)需填寫具體的計(jì)算內(nèi)容，預(yù)期結(jié)構(gòu)，分子結(jié)構(gòu)及相關(guān)的參考文獻(xiàn)。如果網(wǎng)站上沒有對應(yīng)的項(xiàng)目請選擇【私人定制】并在需求中寫明具體計(jì)算內(nèi)容；

2.如果不能確定計(jì)算內(nèi)容，可以直接聯(lián)系工作人員進(jìn)行需求溝通。

學(xué)術(shù)文章

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2024/06

綜述：網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)在生物醫(yī)藥領(lǐng)域的應(yīng)用

引言網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)是一種系統(tǒng)生物學(xué)方法，它通過分析藥物、靶標(biāo)、疾病及其相互作用的復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)來研究藥物的...

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